我校研究机构是专门从事科学研究、技术开发、学术探索等活动的组织或单位。它们致力于解决各种复杂的问题，推动知识的进步和创新。研究机构的类型多种多样，涵盖了自然科学、社会科学、人文艺术等多个领域。目前，我校共有27个研究机构，分别是：

2022年成立的智能制造研究所、绿色建筑可持续发展研究中心、新媒体与短视频创作中心、江浙木雕文化研究中心、产业发展与治理创新研究院、空间设计中心、文化经典与生命叙事研究中心、广厦大学-巴西圣保罗大学物理联合研究中心、物流电商研究中心、体育文化与校园足球研究中心、互联网与数字经济研究所、东阳江文化研究中心、建筑业税财一体化研究中心、智能机器人研究中心、运动与体质健康研究中心、语言文化应用研究中心、品牌形象研究中心、礼仪文化研究所。

2023年成立的视觉传达设计研究所、中药创新研究工作室、生物医药产业研究院、乡村振兴与园林设计研究院、生态环境科技设计研究院、广厦智慧云联研究院。

2024年成立的中国婺派建筑研究院（金华级）。2025年成立的东阳木雕产业创新研究院、木雕红木家居产业学院。